শেখর বন্দ্যোপাধ্যায় ছিলেন নিউজিল্যান্ড ইন্ডিয়া রিসার্চ ইনস্টিটিউটের প্রতিষ্ঠাতা পরিচালক। শিকাগো বিশ্ববিদ্যালয়, অস্ট্রেলিয়ান ন্যাশনাল ইউনিভার্সিটি, ন্যাশনাল ইউনিভার্সিটি অফ সিঙ্গাপুর, স্কুল অফ ওরিয়েন্টাল অ্যান্ড আফ্রিকান স্টাডিজ, ইন্টারন্যাশনাল ইনস্টিটিউট অফ এশিয়ান স্টাডিজ (লিডেন), কার্টিন ইউনিভার্সিটি, কলকাতা ইউনিভার্সিটি এবং রবীন্দ্র ভারতী বিশ্ববিদ্যালয়ে অংশগ্রহণ করেছেন পরিদর্শক হিসেবে। নিউজিল্যান্ড জার্নাল অফ এশিয়ান স্টাডিজের সহযোগী সম্পাদকের দায়িত্ব পালন করছেন। নিউজিল্যান্ড একাডেমী অফ হিউম্যানিটিস এর উদ্বোধনী ফেলো এবং নিউজিল্যান্ডের রয়্যাল সোসাইটির একজন ফেলো হিসেবে নিযুক্ত রয়েছেন।
পেয়েছেন ভারতের পশ্চিমবঙ্গে বাংলা একাডেমি প্রদত্ত রবীন্দ্র স্মৃতি পুরস্কার।
